《时光与他恰是正好》结局是he，林惜和季君行感情圆满，最后怀孕，带着孩子两人走入了婚姻的殿堂。
最近年级突然疯传，一班那个季君行居然有个未婚妻。一干跟季少爷自小相识的，打趣问道：阿行，你什么背着我们偷偷藏了个未婚妻啊?季君行微眯着眼，淡淡吐出四个字：关、你、屁、事。发小立即起哄的更厉害，大喊道：不否认那就是有咯。终于，前面那个始终淡定的背影，有了反应。哟，她耳朵根儿红了。
全国高校比赛中，林惜被身穿比赛服的男人捉住，众目睽睽之下，她黑色毛衣的领子被扯下，露出脖子上带着的银色链子，还有链子上坠着的戒指，季君行看着戒指：你戴着我送的戒指，想往哪儿跑?
女主角的童年，是和哥哥一起度过的。可谁知，哥哥遭遇了车祸，离开了人世。父母为了让哥哥能够以另一种方式留在人间，因此，签订了器官捐献同意书。哥哥的器官，被捐献给了需要的人。阴差阳错，这个人，就是该剧当中的男主角了。女主角的父母和男主角的父母，通过私下的方式取得了联系。
男主角的母亲，帮助女主角转学来到儿子就读的高中，机缘巧合，男女主角更是被分在了同一个班级当中。女主角知道哥哥器官捐献给男主角的事情。这件事情，只有男主角自己不知道。因此，女主角对于男主，有着一种特殊的兄妹情感。而这种情感，被男主角误会，因此，开局故事当中，男主角是处处躲着女主角的。
当然，随着故事的推进，男女主角在校园学习当中，开始经历各种事情，继而，两人之间出现了更多的彼此欣赏。而在能够恋爱的年纪之后，男女主角的情感快速升温，继而成为爱情。这部电视剧最终的结局，已经在剧作的一开局便放送给了观众们：男女主角大学毕业之后，便结婚了，幸福长跑，越跑越幸福。