日本西之表市马毛岛涉及美军机训练转移的自卫队基地工程中，防卫省与国土交通省多次变更合同，导致基地工程费用超支。自2022年1月工程发包以来，工程费用在约4年间从初始合同总额的4342亿日元增至9726亿日元，项目总额增至初始的2.2倍。有关方面以材料费和人工成本上涨、工期延长等为由上调项目金额，未经招标的增额已超过5300亿日元。防卫省并未公布工程总费用，费用恐将持续膨胀。
资料显示，国土交通省九州地方整备局的6项工程在2022至2025年期间累计金额达5767亿日元，防卫省九州防卫局熊本防卫支局的105项工程累计金额达3958亿日元。二者工程耗资均超预估。
政府多次变更合同，导致西之表市马毛岛基地建设项目费用翻番，并给人带来预算估算不足、仓促推进的感觉。在政府谋求通过增税进一步增加防卫费用的背景下，项目透明性备受质疑。
变更合同是对追加工程等引起的增减费用及工期延长的处理程序，由承包方报价并经发包方协商确认。不同于多家企业参与的公开竞争性招标，变更合同的竞争机制较弱。
日本2026年度预算案中列出的防卫费已突破9万亿日元，远高于公共事业与文教科学振兴费（6万亿日元）。预计今后防卫费将继续增长，政府已决定通过增税确保财源。为了争取国民理解，政府本不应浪费预算。
专家担忧，政府承诺投入巨额防卫费，在预算使用上缺乏紧迫感。马毛岛建设曾在未充分向当地作出说明的情况下，挪用美军相关经费用于支付未列入初期预算的项目费用。若以“防卫机密”为挡箭牌而不保障透明度，外部监督机制难以发挥作用，可能导致预算被随意使用。