10月19日~26日8时，内蒙古阿拉善盟额济纳旗累计新增本土确诊病例78例，系本轮疫情中确诊病例数目最多的地方。此外，本轮疫情报告的斤200例感染者中，已有超过一半病例与旅行团传播链有关，多条旅行团传播链的行程共同指向额济纳旗。
人民日报健康客户端梳理发现，官方资料显示，额济纳旗是内蒙古自治区面积最大、人口最少的旗。根据第七次人口普查数据，截至2020年11月1日零时，额济纳旗常住人口仅有35756人，每平方公里仅有约0.3人。
为何地广人稀的额济纳旗会出现多名病例?首先，额济纳旗地处内蒙古自治区最西端，北与蒙古国接壤，边境线长507公里，地理位置、地形地势与气候共同塑造了一个可以观赏大漠自然风光的额济纳旗，目前额济纳旗境内景区(点)包括胡杨林景区、大漠胡杨林景区、东风航天城(酒泉卫星发射中心)、黑城弱水胡杨风景区、沃布格德音淖尔(老人湖)、居延海等。今年7月，在内蒙古自治区文化和旅游厅主办的2021年内蒙古网红打卡地评选活动中，额济纳旗胡杨林景区入选了66个“内蒙古网红打卡地”。
金秋时节，正是额济纳旗的旅游旺季。
2019年，额济纳旗预计接待游客突破810万人次，同比增长14%;实现旅游综合收入78亿元，同比增长14%。第三产业产值占全区生产总值比重超过三分之二。
国家卫生健康委疾控局副局长吴良有在10月24日的新闻发布会上表示，本轮疫情病例的病毒全基因组序列与国内此前的疫情的同源性低，提示本次疫情是由一起新的境外输入源头引起。
本轮疫情的病例是如何从境外传入尚未明确，根据已公布的病例行程轨迹，有多名病例曾有额济纳旗策克口岸居旅史。
例如，甘肃兰州旅行团5例感染者曾于10月13日前往策克口岸参观，之后与上海退休老夫妻有交集;巴彦浩特镇一货车司机新冠阳性，曾在额济纳旗策克口岸装煤;银川导游在甘肃天水确诊，曾去额济纳旗策克口岸;10月22日，额济纳旗通报19例确诊病例详情，其中病例15、病例16均为居住在策克口岸的工地工人。病例15近一个月一直在额济纳旗居住和生活，病例16王某某主要轨迹涉及工地、宿舍、餐馆、超市，无外出史。
据策克出入境边防检查站官方微信公众号9月18日消息，蒙古国新冠疫情持续恶化蔓延，策克口岸频繁出现跨境货运司机核酸样本检测呈阳性情况，疫情外防输入风险突增。
策克口岸是全国第四、内蒙古第三大陆路口岸，也是我国西北连通国内外的重要交通枢纽、商贸中心、货物集散地和资源大通道，距离该旗旗府所在地达来呼布镇约80公里。策克口岸国际文化旅游区于2019年12月被评为国家AAA级旅游景区，设有界碑广场、国际蒙元文化风情城、离岸免税欧洲商品购物城、中蒙边民互贸市场、铁路口岸国门及广场等。
10月18日，策克口岸已对各交通出入口实行交通管制，暂停开放策克口岸国际文化旅游区。